Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms