Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms