Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms