Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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