Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms