Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms