Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN2Q504Q3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAN2Q504Q3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAN2Q504Q3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAN2Q504Q3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAN2Q504Q3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAN2Q504Q3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms