Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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