Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms