Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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