Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms