Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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