Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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