Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms