Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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