Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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SS18Q15532 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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SS18Q15532 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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SS18Q15532 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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SS18Q15532 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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SS18Q15532 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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SS18Q15532 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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SS18Q15532 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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SS18Q15532 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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