Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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