Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PCLAFQ15004 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PCLAFQ15004 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PCLAFQ15004 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PCLAFQ15004 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PCLAFQ15004 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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