Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SHPRHQ149N8 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SHPRHQ149N8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SHPRHQ149N8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SHPRHQ149N8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SHPRHQ149N8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SHPRHQ149N8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SHPRHQ149N8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SHPRHQ149N8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SHPRHQ149N8 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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