Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms