Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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GTF2H3Q13889 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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GTF2H3Q13889 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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