Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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