Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms