Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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IFT88Q13099 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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IFT88Q13099 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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IFT88Q13099 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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IFT88Q13099 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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IFT88Q13099 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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