Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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