Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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