Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms