Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms