Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms