Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316.4 ms