Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms