Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms