Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRKCDQ05655 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms