Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms