Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 BLNK-204ENST00000427367 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LINC01865-202ENST00000436808 853 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LMNTD1-203ENST00000445693 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LINC01099-202ENST00000512527 578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NUP43-203ENST00000367404 1089 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AP001596.1-203ENST00000421771 1078 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FAM104B-205ENST00000477847 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms