Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms