Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A2Q01362 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms