Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms