Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms