Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms