Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1GDS1P52306 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms