Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUFMP49411 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUFMP49411 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUFMP49411 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms