Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms