Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX1P48742 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms