Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms