Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms