Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP2P42575 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CASP2P42575 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP2P42575 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms