Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms