Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPOP42166 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms