Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms